Od roku 2024 probíhá dlouho očekávaná a potřebná modernizace dráhy císaře Františka Josefa, konkrétně v úseku Wien–Gmünd. Cílem Rakouských spolkových drah je zdvoukolejnění několika úseků, zvýšení traťové rychlosti až na 160 km/h a modernizace stanic, jejichž zabezpečovací zařízení již neodpovídá požadavkům dnešního hustého provozu. Součástí projektu je také výstavba trianglu ve stanici Sigmundsherberg, který umožní zavedení přímého spojení mezi okresním městem Horn a Vídní. Přestože se většina dosavadních prací cestujících zatím téměř nedotkla, instalace nových trakčních stožárů v úseku Absdorf-Hippersdorf – Limberg-Maissau si vyžádala téměř dvouměsíční výluku provozu.

Přestože je trať Wien–Gmünd velmi vytížená, odbočují z ní lokálky, jejichž největší sláva je již minulostí. Jednou z nich je i trať Schwarzenau – Waidhofen an der Thaya – Slavonice, která se od svého vzniku potýkala s řadou problémů. Přibližně v roce 2007 se objevila největší naděje na obnovení přeshraničního provozu, podpořená podepsanými memorandy i stanovenými termíny. Hospodářská krize v roce 2009 však přinutila ÖBB hledat úspory a budoucnost tratě do Slavonic se znovu ocitla v ohrožení. Rakouský stát se následně s ÖBB dohodl na převodu tratě do vlastnictví spolkové země Dolní Rakousko. Ta však dospěla k závěru, že další provoz železnice by byl ekonomicky neudržitelný a vyžadoval by vysoké investice. Proto bylo rozhodnuto o přeměně části tratě na cyklostezku. Jedinou připomínkou někdejších plánů na obnovení provozu tak zůstává zrekonstruovaná stanice ve Slavonicích.

V úseku Schwarzenau – Waidhofen an der Thaya zůstala železniční trať zachována dodnes, osobní doprava zde však skončila 12. prosince 2010. Ze Schwarzenau vede trať přibližně tři kilometry souběžně s dráhou císaře Františka Josefa, načež se od ní odpojuje směrem na sever. Právě na tomto krátkém úseku falešné dvoukolejky byl zachycen projíždějící vlak 19540 ve výlukovém složení na své cestě ze Sigmundsherbergu do Gmündu.